南通理工学院工会委员会成立于2003年，下设20个工会小组。校工会委员会下设经费审查委员会、女职工委员会等工作机构。教代会下设执行委员会、调解委员会和提案工作委员会，校工会为教职工代表大会闭会期间履行教代会职权的日常机构。

南通理工学院工会委员会在校党委和上级工会的领导下，紧紧围绕学校中心工作和发展目标，认真履行工会“维护、建设、参与、教育”四项基本职能，充分发挥工会组织的桥梁纽带作用，在工会自身建设、参与学校民主管理、为教职工办实事、丰富教职工文化生活、推进和谐校园建设等方面做出了富有成效的工作，为学校的改革发展稳定作出了积极的贡献。

校工会工作得到学校领导和上级工会组织的肯定，受到广大教职工的信赖，2006年、2012年分别获“南通市模范职工之家”称号，2014年获“协同行政参与学校管理创新二等奖”，2018年获“江苏省模范职工之家”，2019年获“十佳创新型工会组织”“南通市厂务公开民主管理先进单位”，2020年获“江苏省厂务公开民主管理先进单位”。

工会将进一步按照“党政所需、职工所愿、工会所能”的要求，与时俱进、勇立潮头、锐意改革，着力增强“三性”（政治性、先进性、群众性）、去除“四化”（机关化、行政化、贵族化、娱乐化），用全心全意的服务凝聚人心，用创新创优的精神展示魅力，用求实求精的作为演绎辉煌，努力开创工会工作新局面。